Bioconductor Single Package Builder - Build History

Snapshot Date: 
URL:  https://git.bioconductor.org/packages/pareg
Last Changed Rev:  / Revision: 
Last Changed Date: 

Hostname OS /Arch BUILD CHECK BUILD BIN POST-PROCESSING
merida1 macOS 10.14.6 Mojave/x86_64   OK     ERROR     OK     OK  
nebbiolo1 Linux (Ubuntu 20.04.4 LTS)/x86_64   OK     ERROR     skipped     OK  

merida1 Summary

[top]

Package: pareg
Version: 0.99.6
RVersion: 4.2
BiocVersion: 3.15
BuildCommand: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/Current/Resources/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data pareg
BuildTime: 1 minutes 47.11 seconds
CheckCommand: BiocCheckGitClone('pareg') && /Library/Frameworks/R.framework/Versions/Current/Resources/bin/R CMD check --no-vignettes --timings --no-multiarch pareg_0.99.6.tar.gz && BiocCheck('pareg_0.99.6.tar.gz', `new-package`=TRUE)
CheckTime: 11 minutes 25.36 seconds
BuildBinCommand: /Users/biocbuild/BBS/utils/build-universal.sh pareg_0.99.6.tar.gz /Library/Frameworks/R.framework/Versions/Current/Resources/bin/R libdir
BuildBinTime: 0 minutes 21.94 seconds
PackageFileSize: 810.83 KiB
BuildID:: pareg_20220315101447
PreProcessing: Starting Git clone. Installing dependencies. Checking Git Clone. Installing package: pareg. Starting Build package. Starting Check package. Starting Build package.
PostProcessing: Finished Git clone. Package type: Software. Installing dependency status: 0. Checking git clone status: 0. Installing package status: 0. Build Package status: 0. Checking Package status: 1. Build Package status: 0.

merida1 BUILD SRC output

[top]

===============================

 R CMD BUILD

===============================

* checking for file ‘pareg/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘pareg’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... OK
* checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
* checking for empty or unneeded directories
* building ‘pareg_0.99.6.tar.gz’

merida1 CHECK output

[top]

===============================

 BiocCheckGitClone('pareg')

===============================

This is BiocCheckGitClone version 1.31.36. BiocCheckGitClone is a work
in progress. Output and severity of issues may change.
* Checking valid files...
* Checking DESCRIPTION...
* Checking if DESCRIPTION is well formatted...
* Checking for valid maintainer...
* Checking CITATION...
* Checking that provided CITATION file is correctly formatted...


Summary:
ERROR count: 0
WARNING count: 0
NOTE count: 0
For detailed information about these checks, see the BiocCheck
vignette, available at
https://bioconductor.org/packages/3.15/bioc/vignettes/BiocCheck/inst/doc/BiocCheck.html#interpreting-bioccheck-output




===============================

 R CMD CHECK

===============================

* using log directory ‘/Users/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg.Rcheck’
* using R Under development (unstable) (2022-03-02 r81842)
* using platform: x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit)
* using session charset: UTF-8
* using option ‘--no-vignettes’
* checking for file ‘pareg/DESCRIPTION’ ... OK
* this is package ‘pareg’ version ‘0.99.6’
* package encoding: UTF-8
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... OK
* checking if this is a source package ... OK
* checking if there is a namespace ... OK
* checking for hidden files and directories ... OK
* checking for portable file names ... OK
* checking for sufficient/correct file permissions ... OK
* checking whether package ‘pareg’ can be installed ... [23s/23s] OK
* checking installed package size ... OK
* checking package directory ... OK
* checking for future file timestamps ... OK
* checking ‘build’ directory ... OK
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* checking top-level files ... OK
* checking for left-over files ... OK
* checking index information ... OK
* checking package subdirectories ... OK
* checking R files for non-ASCII characters ... OK
* checking R files for syntax errors ... OK
* checking whether the package can be loaded ... OK
* checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
* checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
* checking loading without being on the library search path ... OK
* checking use of S3 registration ... OK
* checking dependencies in R code ... OK
* checking S3 generic/method consistency ... OK
* checking replacement functions ... OK
* checking foreign function calls ... OK
* checking R code for possible problems ... [24s/24s] NOTE
fit: no visible global function definition for ‘%as%’
Undefined global functions or variables:
  %as%
* checking Rd files ... [0s/0s] OK
* checking Rd metadata ... OK
* checking Rd line widths ... OK
* checking Rd cross-references ... OK
* checking for missing documentation entries ... OK
* checking for code/documentation mismatches ... OK
* checking Rd \usage sections ... OK
* checking Rd contents ... OK
* checking for unstated dependencies in examples ... OK
* checking installed files from ‘inst/doc’ ... OK
* checking files in ‘vignettes’ ... OK
* checking examples ... [28s/133s] ERROR
Running examples in ‘pareg-Ex.R’ failed
The error most likely occurred in:

> base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
> ### Name: cv.edgenet
> ### Title: Find the optimal shrinkage parameters for edgenet
> ### Aliases: cv.edgenet cv.edgenet,matrix,numeric-method
> ###   cv.edgenet,matrix,matrix-method
> 
> ### ** Examples
> 
> X <- matrix(rnorm(100 * 10), 100, 10)
> b <- matrix(rnorm(100), 10)
> G.X <- abs(rWishart(1, 10, diag(10))[, , 1])
> G.Y <- abs(rWishart(1, 10, diag(10))[, , 1])
> diag(G.X) <- diag(G.Y) <- 0
> 
> # estimate the parameters of a Gaussian model
> Y <- X %*% b + matrix(rnorm(100 * 10), 100)
> 
> ## dont use affinity matrices and estimate lambda
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:20:43.887537: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7f945e6f4110 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:20:43.887572: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:20:50.679352: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7fa4bdd9c3b0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:20:50.679379: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> ## only provide one matrix and estimate lambda
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   psigx = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:21:02.685085: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7fcde631fc70 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:02.685115: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:21:09.440224: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7ff5cf882c40 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:09.440250: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> ## estimate only lambda with two matrices
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   psigx = 1,
+   psigy = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:21:21.532990: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7fe448a7b950 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:21.533022: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:21:28.277871: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7ffda3b157f0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:28.277897: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> ## estimate only psigx
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   lambda = 1,
+   psigy = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   psigx_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:21:40.532048: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7f919c65f9a0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:40.532079: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:21:47.289143: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7fbf8d946e30 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:47.289168: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> ## estimate all parameters
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1),
+   psigx_range = c(0, 1),
+   psigy_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:21:59.524090: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7fcde500c750 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:21:59.524124: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%2022-03-15 10:22:06.324514: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7f9081b32260 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:22:06.324541: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> ## if Y is vectorial, we cannot use an affinity matrix for Y
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y[, 1],
+   G.X = G.X,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1),
+   psigx_range = c(0, 1),
+ )
2022-03-15 10:22:20.102594: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7faa81602870 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:22:20.102627: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%2022-03-15 10:22:26.861760: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x7ff416e0f5b0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:22:26.861789: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.1
Loaded Tensorflow version 2.3.1
> 
> 
> 
> base::assign(".dptime", (proc.time() - get(".ptime", pos = "CheckExEnv")), pos = "CheckExEnv")
> base::cat("cvedgenet-methods", base::get(".format_ptime", pos = 'CheckExEnv')(get(".dptime", pos = "CheckExEnv")), "\n", file=base::get(".ExTimings", pos = 'CheckExEnv'), append=TRUE, sep="\t")
> cleanEx()
Error: connections left open:
	<-localhost:32405 (sockconn)
	<-localhost:32405 (sockconn)
Execution halted
* checking for unstated dependencies in ‘tests’ ... OK
* checking tests ...
  Running ‘testthat.R’ [312s/378s]
 [312s/378s] OK
* checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
* checking package vignettes in ‘inst/doc’ ... OK
* checking running R code from vignettes ... SKIPPED
* checking re-building of vignette outputs ... SKIPPED
* checking PDF version of manual ... OK
* DONE

Status: 1 ERROR, 1 NOTE
See
  ‘/Users/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg.Rcheck/00check.log’
for details.





===============================

 BiocCheck('pareg_0.99.6.tar.gz')

===============================

This is BiocCheck version 1.31.36. BiocCheck is a work in progress.
Output and severity of issues may change. Installing package...
* Checking Package Dependencies...
Warning in system2(cmd, args, stdout = TRUE, stderr = FALSE, env = "R_DEFAULT_PACKAGES=NULL") :
  running command 'R_DEFAULT_PACKAGES=NULL '/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R' -q --vanilla --slave -f /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/library/BiocCheck/script/checkBadDeps.R --args "/Users/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg_0.99.6.tar.gz" "/var/folders/7y/c__3_48d5y18p1_rhfs_4x9c0000gt/T//Rtmpk088BT/file9202d5e09f5/lib" 2>/dev/null' had status 1
* Checking if other packages can import this one...
* Checking to see if we understand object initialization...
* Checking for deprecated package usage...
* Checking for remote package usage...
* Checking for 'LazyData: true' usage...
* Checking version number...
* Checking for version number mismatch...
* Checking new package version number...
* Checking R Version dependency...
* Checking package size...
* Checking individual file sizes...
* Checking biocViews...
* Checking that biocViews are present...
* Checking package type based on biocViews...
    Software
* Checking for non-trivial biocViews...
* Checking that biocViews come from the same category...
* Checking biocViews validity...
* Checking for recommended biocViews...
* Checking build system compatibility...
* Checking for blank lines in DESCRIPTION...
* Checking if DESCRIPTION is well formatted...
* Checking for proper Description: field...
* Checking for whitespace in DESCRIPTION field names...
* Checking that Package field matches directory/tarball name...
* Checking for Version field...
* Checking for valid maintainer...
* Checking License: for restrictive use...
* Checking for pinned package versions...
* Checking DESCRIPTION/NAMESPACE consistency...
* Checking .Rbuildignore...
* Checking vignette directory...
* Checking whether vignette is built with 'R CMD build'...
* Checking package installation calls in R code...
* Checking for library/require of pareg...
* Checking coding practice...
* Checking parsed R code in R directory, examples, vignettes...
* Checking function lengths...
    * NOTE: Recommended function length <= 50 lines.
      There are 9 functions > 50 lines.
      The longest 5 functions are:
        .cv.edgenet_gridsearch() (R/netreg.R, line 1047): 111 lines
        _anonymous_.857() (R/netreg.R, line 857): 101 lines
        pareg() (R/main.R, line 43): 95 lines
        .cv.edgenet_optim() (R/netreg.R, line 961): 81 lines
        plot_pareg_with_args() (R/plotting.R, line 42): 79 lines
* Checking man page documentation...

* Checking package NEWS...
* Checking unit tests...
* Checking skip_on_bioc() in tests...
* Checking formatting of DESCRIPTION, NAMESPACE, man pages, R source,
  and vignette source...
    * NOTE: Consider shorter lines; 9 lines (0%) are > 80 characters
      long.
    First 6 lines:
      vignettes/pareg.Rmd:17 It estimates pathway enrichment scores by regres...
      vignettes/pareg.Rmd:18 These scores are computed using a regularized ge...
      vignettes/pareg.Rmd:19 The network regularization term is based on a pa...
      vignettes/pareg.Rmd:32 We start our analysis by loading the `pareg` pac...
      vignettes/pareg.Rmd:49 For the sake of this introductory example, we ge...
      vignettes/pareg.Rmd:81 Before starting the actual enrichment estimation...
    * NOTE: Consider multiples of 4 spaces for line indents, 1041
      lines(30%) are not.
    First 6 lines:
      R/main.R:44   df_genes,
      R/main.R:45   df_terms,
      R/main.R:46   lasso_param = NA_real_,
      R/main.R:47   network_param = NA_real_,
      R/main.R:48   term_network = NULL,
      R/main.R:49   cv = FALSE,
    See http://bioconductor.org/developers/how-to/coding-style/
    See styler package: https://cran.r-project.org/package=styler as
      described in the BiocCheck vignette.
* Checking if package already exists in CRAN...
* Checking if new package already exists in Bioconductor...
* Checking for bioc-devel mailing list subscription...
    Maintainer is subscribed to bioc-devel.
* Checking for support site registration...
    Maintainer is registered at support site.
    Package name is in support site watched tags.


Summary:
ERROR count: 0
WARNING count: 0
NOTE count: 3
For detailed information about these checks, see the BiocCheck
vignette, available at
https://bioconductor.org/packages/3.15/bioc/vignettes/BiocCheck/inst/doc/BiocCheck.html#interpreting-bioccheck-output

merida1 BUILD BIN output

[top]

===============================

 R CMD BUILD

===============================

>>>>>>> 
>>>>>>> INSTALLATION WITH 'R CMD INSTALL --preclean --no-multiarch --library=libdir pareg_0.99.6.tar.gz'
>>>>>>> 

* installing *source* package ‘pareg’ ...
** using staged installation
** R
** inst
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (pareg)

nebbiolo1 Summary

[top]

Package: pareg
Version: 0.99.6
RVersion: 4.2
BiocVersion: 3.15
BuildCommand: /home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/bin/R CMD build --keep-empty-dirs --no-resave-data pareg
BuildTime: 1 minutes 11.40 seconds
CheckCommand: BiocCheckGitClone('pareg') && /home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/bin/R CMD check --no-vignettes --timings pareg_0.99.6.tar.gz && BiocCheck('pareg_0.99.6.tar.gz', `new-package`=TRUE)
CheckTime: 7 minutes 52.32 seconds
BuildBinCommand:
BuildBinTime:
PackageFileSize: 822.49 KiB
BuildID:: pareg_20220315101447
PreProcessing: Starting Git clone. Installing dependencies. Checking Git Clone. Installing package: pareg. Starting Build package. Starting Check package.
PostProcessing: Finished Git clone. Package type: Software. Installing dependency status: 0. Checking git clone status: 0. Installing package status: 0. Build Package status: 0. Checking Package status: 1.

nebbiolo1 BUILD SRC output

[top]

===============================

 R CMD BUILD

===============================

* checking for file ‘pareg/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘pareg’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ... OK
* checking for LF line-endings in source and make files and shell scripts
* checking for empty or unneeded directories
* building ‘pareg_0.99.6.tar.gz’

nebbiolo1 CHECK output

[top]

===============================

 BiocCheckGitClone('pareg')

===============================

This is BiocCheckGitClone version 1.31.36. BiocCheckGitClone is a work
in progress. Output and severity of issues may change.
* Checking valid files...
* Checking DESCRIPTION...
* Checking if DESCRIPTION is well formatted...
* Checking for valid maintainer...
* Checking CITATION...
* Checking that provided CITATION file is correctly formatted...


Summary:
ERROR count: 0
WARNING count: 0
NOTE count: 0
For detailed information about these checks, see the BiocCheck
vignette, available at
https://bioconductor.org/packages/3.15/bioc/vignettes/BiocCheck/inst/doc/BiocCheck.html#interpreting-bioccheck-output




===============================

 R CMD CHECK

===============================

* using log directory ‘/home/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg.Rcheck’
* using R Under development (unstable) (2022-02-17 r81757)
* using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
* using session charset: UTF-8
* using option ‘--no-vignettes’
* checking for file ‘pareg/DESCRIPTION’ ... OK
* this is package ‘pareg’ version ‘0.99.6’
* package encoding: UTF-8
* checking package namespace information ... OK
* checking package dependencies ... OK
* checking if this is a source package ... OK
* checking if there is a namespace ... OK
* checking for hidden files and directories ... OK
* checking for portable file names ... OK
* checking for sufficient/correct file permissions ... OK
* checking whether package ‘pareg’ can be installed ... [17s/17s] OK
* checking installed package size ... OK
* checking package directory ... OK
* checking for future file timestamps ... OK
* checking ‘build’ directory ... OK
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* checking top-level files ... OK
* checking for left-over files ... OK
* checking index information ... OK
* checking package subdirectories ... OK
* checking R files for non-ASCII characters ... OK
* checking R files for syntax errors ... OK
* checking whether the package can be loaded ... OK
* checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK
* checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies ... OK
* checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK
* checking loading without being on the library search path ... OK
* checking use of S3 registration ... OK
* checking dependencies in R code ... OK
* checking S3 generic/method consistency ... OK
* checking replacement functions ... OK
* checking foreign function calls ... OK
* checking R code for possible problems ... [18s/18s] NOTE
fit: no visible global function definition for ‘%as%’
Undefined global functions or variables:
  %as%
* checking Rd files ... [0s/0s] OK
* checking Rd metadata ... OK
* checking Rd line widths ... OK
* checking Rd cross-references ... OK
* checking for missing documentation entries ... OK
* checking for code/documentation mismatches ... OK
* checking Rd \usage sections ... OK
* checking Rd contents ... OK
* checking for unstated dependencies in examples ... OK
* checking installed files from ‘inst/doc’ ... OK
* checking files in ‘vignettes’ ... OK
* checking examples ... [23s/99s] ERROR
Running examples in ‘pareg-Ex.R’ failed
The error most likely occurred in:

> base::assign(".ptime", proc.time(), pos = "CheckExEnv")
> ### Name: cv.edgenet
> ### Title: Find the optimal shrinkage parameters for edgenet
> ### Aliases: cv.edgenet cv.edgenet,matrix,numeric-method
> ###   cv.edgenet,matrix,matrix-method
> 
> ### ** Examples
> 
> X <- matrix(rnorm(100 * 10), 100, 10)
> b <- matrix(rnorm(100), 10)
> G.X <- abs(rWishart(1, 10, diag(10))[, , 1])
> G.Y <- abs(rWishart(1, 10, diag(10))[, , 1])
> diag(G.X) <- diag(G.Y) <- 0
> 
> # estimate the parameters of a Gaussian model
> Y <- X %*% b + matrix(rnorm(100 * 10), 100)
> 
> ## dont use affinity matrices and estimate lambda
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:18:53.331171: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:18:54.761584: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:18:54.807512: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:18:54.807592: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:18:54.807962: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:18:54.817501: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:18:54.820624: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x5654aa7dd300 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:18:54.820667: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:18:58.613211: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:18:59.909423: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:18:59.953432: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:18:59.953516: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:18:59.953851: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:18:59.963594: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:18:59.967136: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55993c13b330 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:18:59.967186: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> ## only provide one matrix and estimate lambda
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   psigx = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:19:07.422506: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:19:08.908393: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:19:08.956658: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:08.956721: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:08.957364: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:08.966925: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:08.971677: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55d37dd1b5c0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:08.971775: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:13.174653: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:14.628962: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:14.673517: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:14.673644: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:14.674022: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:14.683967: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:14.686849: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55a32abdef90 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:14.686964: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> ## estimate only lambda with two matrices
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   psigx = 1,
+   psigy = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:19:21.831401: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:19:23.210127: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:19:23.257888: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:23.257946: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:23.258277: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:23.267671: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:23.270472: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x56028e12d860 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:23.270588: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:27.218475: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:28.648981: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:28.671358: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:28.671414: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:28.671755: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:28.681546: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:28.684568: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55fb2cd2e5c0 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:28.684633: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> ## estimate only psigx
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   lambda = 1,
+   psigy = 1,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   psigx_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:19:35.983813: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:19:37.278529: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:19:37.325748: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:37.325826: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:37.326174: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:37.335406: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:37.338530: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x565103375440 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:37.338589: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:41.083310: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:42.332656: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:42.380248: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected

 2022-03-15 10:19:42.380310: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:42.380778: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:42.390019: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%2022-03-15 10:19:42.393142: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x5598f04b1270 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:42.393196: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> ## estimate all parameters
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y,
+   G.X = G.X,
+   G.Y,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1),
+   psigx_range = c(0, 1),
+   psigy_range = c(0, 1)
+ )
2022-03-15 10:19:49.400394: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:19:50.723613: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:19:50.770787: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:50.770860: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:50.771229: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:50.780676: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:19:50.783968: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x562944c37360 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:50.784029: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%2022-03-15 10:19:54.653819: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%2022-03-15 10:19:56.007253: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%2022-03-15 10:19:56.054178: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:19:56.054225: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:19:56.054568: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:19:56.064431: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz

 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%2022-03-15 10:19:56.067573: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55fb1e9a8b90 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:19:56.067607: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────                         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────────────         100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> ## if Y is vectorial, we cannot use an affinity matrix for Y
> fit <- cv.edgenet(
+   X = X,
+   Y = Y[, 1],
+   G.X = G.X,
+   family = gaussian,
+   maxit = 1,
+   lambda_range = c(0, 1),
+   psigx_range = c(0, 1),
+ )
2022-03-15 10:20:04.688552: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1
2022-03-15 10:20:06.057687: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1
2022-03-15 10:20:06.107278: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:20:06.107358: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:20:06.107852: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.
2022-03-15 10:20:06.118179: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:20:06.121671: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x555e52bb0d80 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:20:06.121734: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────                                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%2022-03-15 10:20:10.049401: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcudart.so.10.1

 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%2022-03-15 10:20:11.351931: I tensorflow/stream_executor/platform/default/dso_loader.cc:48] Successfully opened dynamic library libcuda.so.1

 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%2022-03-15 10:20:11.399395: E tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_driver.cc:314] failed call to cuInit: CUDA_ERROR_NO_DEVICE: no CUDA-capable device is detected
2022-03-15 10:20:11.399462: I tensorflow/stream_executor/cuda/cuda_diagnostics.cc:156] kernel driver does not appear to be running on this host (nebbiolo1): /proc/driver/nvidia/version does not exist
2022-03-15 10:20:11.399825: I tensorflow/core/platform/cpu_feature_guard.cc:142] This TensorFlow binary is optimized with oneAPI Deep Neural Network Library (oneDNN)to use the following CPU instructions in performance-critical operations:  AVX2 AVX512F FMA
To enable them in other operations, rebuild TensorFlow with the appropriate compiler flags.

 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%2022-03-15 10:20:11.409303: I tensorflow/core/platform/profile_utils/cpu_utils.cc:104] CPU Frequency: 2200000000 Hz
2022-03-15 10:20:11.412233: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:168] XLA service 0x55cebc642560 initialized for platform Host (this does not guarantee that XLA will be used). Devices:
2022-03-15 10:20:11.412275: I tensorflow/compiler/xla/service/service.cc:176]   StreamExecutor device (0): Host, Default Version

 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ────────────────────────────────────────────────                 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%
 Progress: ──────────────────────────────────────────────────────────────── 100%Loaded Tensorflow version 2.3.0
Loaded Tensorflow version 2.3.0
> 
> 
> 
> base::assign(".dptime", (proc.time() - get(".ptime", pos = "CheckExEnv")), pos = "CheckExEnv")
> base::cat("cvedgenet-methods", base::get(".format_ptime", pos = 'CheckExEnv')(get(".dptime", pos = "CheckExEnv")), "\n", file=base::get(".ExTimings", pos = 'CheckExEnv'), append=TRUE, sep="\t")
> cleanEx()
Error: connections left open:
	<-localhost:28071 (sockconn)
	<-localhost:28071 (sockconn)
Execution halted
* checking for unstated dependencies in ‘tests’ ... OK
* checking tests ...
  Running ‘testthat.R’ [205s/247s]
 [206s/247s] OK
* checking for unstated dependencies in vignettes ... OK
* checking package vignettes in ‘inst/doc’ ... OK
* checking running R code from vignettes ... SKIPPED
* checking re-building of vignette outputs ... SKIPPED
* checking PDF version of manual ... OK
* DONE

Status: 1 ERROR, 1 NOTE
See
  ‘/home/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg.Rcheck/00check.log’
for details.





===============================

 BiocCheck('pareg_0.99.6.tar.gz')

===============================

This is BiocCheck version 1.31.36. BiocCheck is a work in progress.
Output and severity of issues may change. Installing package...
* Checking Package Dependencies...
Warning in system2(cmd, args, stdout = TRUE, stderr = FALSE, env = "R_DEFAULT_PACKAGES=NULL") :
  running command 'R_DEFAULT_PACKAGES=NULL '/home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/bin/R' -q --vanilla --slave -f /home/biocbuild/bbs-3.15-bioc/R/library/BiocCheck/script/checkBadDeps.R --args "/home/pkgbuild/packagebuilder/workers/jobs/2537/pareg_20220315101447/pareg_0.99.6.tar.gz" "/tmp/Rtmprl8als/file21a4612be07df6/lib" 2>/dev/null' had status 1
* Checking if other packages can import this one...
* Checking to see if we understand object initialization...
* Checking for deprecated package usage...
* Checking for remote package usage...
* Checking for 'LazyData: true' usage...
* Checking version number...
* Checking for version number mismatch...
* Checking new package version number...
* Checking R Version dependency...
* Checking package size...
* Checking individual file sizes...
* Checking biocViews...
* Checking that biocViews are present...
* Checking package type based on biocViews...
    Software
* Checking for non-trivial biocViews...
* Checking that biocViews come from the same category...
* Checking biocViews validity...
* Checking for recommended biocViews...
* Checking build system compatibility...
* Checking for blank lines in DESCRIPTION...
* Checking if DESCRIPTION is well formatted...
* Checking for proper Description: field...
* Checking for whitespace in DESCRIPTION field names...
* Checking that Package field matches directory/tarball name...
* Checking for Version field...
* Checking for valid maintainer...
* Checking License: for restrictive use...
* Checking for pinned package versions...
* Checking DESCRIPTION/NAMESPACE consistency...
* Checking .Rbuildignore...
* Checking vignette directory...
* Checking whether vignette is built with 'R CMD build'...
* Checking package installation calls in R code...
* Checking for library/require of pareg...
* Checking coding practice...
* Checking parsed R code in R directory, examples, vignettes...
* Checking function lengths...
    * NOTE: Recommended function length <= 50 lines.
      There are 9 functions > 50 lines.
      The longest 5 functions are:
        .cv.edgenet_gridsearch() (R/netreg.R, line 1047): 111 lines
        _anonymous_.857() (R/netreg.R, line 857): 101 lines
        pareg() (R/main.R, line 43): 95 lines
        .cv.edgenet_optim() (R/netreg.R, line 961): 81 lines
        plot_pareg_with_args() (R/plotting.R, line 42): 79 lines
* Checking man page documentation...

* Checking package NEWS...
* Checking unit tests...
* Checking skip_on_bioc() in tests...
* Checking formatting of DESCRIPTION, NAMESPACE, man pages, R source,
  and vignette source...
    * NOTE: Consider shorter lines; 9 lines (0%) are > 80 characters
      long.
    First 6 lines:
      vignettes/pareg.Rmd:17 It estimates pathway enrichment scores by regres...
      vignettes/pareg.Rmd:18 These scores are computed using a regularized ge...
      vignettes/pareg.Rmd:19 The network regularization term is based on a pa...
      vignettes/pareg.Rmd:32 We start our analysis by loading the `pareg` pac...
      vignettes/pareg.Rmd:49 For the sake of this introductory example, we ge...
      vignettes/pareg.Rmd:81 Before starting the actual enrichment estimation...
    * NOTE: Consider multiples of 4 spaces for line indents, 1041
      lines(30%) are not.
    First 6 lines:
      R/main.R:44   df_genes,
      R/main.R:45   df_terms,
      R/main.R:46   lasso_param = NA_real_,
      R/main.R:47   network_param = NA_real_,
      R/main.R:48   term_network = NULL,
      R/main.R:49   cv = FALSE,
    See http://bioconductor.org/developers/how-to/coding-style/
    See styler package: https://cran.r-project.org/package=styler as
      described in the BiocCheck vignette.
* Checking if package already exists in CRAN...
* Checking if new package already exists in Bioconductor...
* Checking for bioc-devel mailing list subscription...
    Maintainer is subscribed to bioc-devel.
* Checking for support site registration...
    Maintainer is registered at support site.
    Package name is in support site watched tags.


Summary:
ERROR count: 0
WARNING count: 0
NOTE count: 3
For detailed information about these checks, see the BiocCheck
vignette, available at
https://bioconductor.org/packages/3.15/bioc/vignettes/BiocCheck/inst/doc/BiocCheck.html#interpreting-bioccheck-output

nebbiolo1 BUILD BIN output

[top]